历史文化村落现在却面临着毁灭性灾难。2012年，我国政府正式启动了传统村落的全面调查，同时进行了专家审定与《中国传统村落名录》的甄选工作。调查显示，我国现有约60万个村庄，其中古村落大约有5000个，占全部村落数量不足1%，不少专家学者感叹，古村落的保护已经到了“最危险的时刻”。
2.在由农耕社会向工业社会的转型中，村落的减少与消亡是正常的，世界各国都是如此，中国也不例外。
调查显示，中国城市化的步伐正在急迫地进行，城市化率已经从1991年的26%发展到2009年的46.6%，应对经济发展的建设用地需求在这一城市化的进程中，既有不可逆转的大趋势，也有不可回避的新问题，“古村落”的急剧减少、萎缩衰败和被乱更新，就是其中之一。
“十一五”规划出台后，各地又掀起了轰轰烈烈的社会主义新农村建设。部分地方把新农村建设片面理解为新村建设，结果许多古村落在盖新房、建楼房的大拆大改大建中遭到破坏。
有评论指出，人们很容易把新农村的形象等同于华西村(华西村是全国农村走共同富裕道路的典型，2009年入选世界纪录协会中国第一村)，这是错误的。中国城市已经遭遇了“千城一面”，如果不抓紧的话，这种悲剧会在农村上演，很多古村落可能我们还没来得及认识它，就要失去它。
调查还指出，另一个值得注意的问题是城镇化拓宽了农民的眼界，导致了新旧观念之间的差异，而差异也间接威胁了古村落的生存状况。农民通过电视、网络和外出打工，了解到现代生活应该是白瓷砖、水泥地和沙发。考虑到通风，他们会把精美的窗花去掉;考虑到美观，他们会把木墙拆除;考虑到更好地改善居住